一直到深夜一點多鐘，潛艇的聲吶兵才監聽到敵人艦隊的蹤跡，大批的敵人從大約4海里外的航道通過。由於日軍實行了嚴格的燈火管制，在潛望鏡里根本看不到敵艦的身影，偶爾能看見敵見在聯絡時發出一閃一閃的燈光信號。

    「大約有多少敵人？」秦海銘說道。

    「聽聲音應該在二十艘左右，長官，但無法判斷具體的數字。」負責回聲探測儀的聲吶兵回答說。

    現在1026號潛艇坐沉在海底的污泥里，根本不敢打開雷達，如果被敵人憑藉雷達波捕捉到他們的位置，那就真的死定了。現在只有靠聲吶兵根據經驗來判斷敵艦的大小和數量。潛艇上的通風裝置被關閉了，艇內顯得更加沉悶，外面的聲響更大了：聲納的乒乒聲，螺旋槳在水裡旋轉的聲音，現在很明顯了，聲響來自前方。

    敵人的艦隊轟隆隆地從前面的航道上駛過，大約有22艘軍艦，不過，聲吶兵報告說後方又傳來大批高速螺旋槳的聲音。

    大約半個小時之後，又有一批敵人從前面駛過，這一次大約有18艘左右的軍艦。

    1026號潛艇一直在潛伏著，大約在3點10分，又有一批敵人從面前駛過，這一次大約有30艘以上的艦船，其中有一半是低速螺旋槳的聲音，應該是敵人的運輸船隊。

    3點40分，聲吶兵報告說沒有再發現敵人的蹤跡。

    「好了，現在負槽排水，開始上浮，我們駛回航道！」秦海銘重新下達了作戰命令，艇身開始搖晃起來。慢慢從污泥里浮出海面，但卻始終用靜航電機在工作著，緩慢地駛向航道。

    「左轉35，主機啟動！」

    潛艇上的柴油機發動了，艙室里又響起了艇員們熟悉的噪聲，潛艇向敵人相反的航向。開始全速駛向爪哇海。

    「向艦隊發報：1點23分，發現敵人第一批艦隊大約22艘軍艦，向南駛過喀拉喀托航道；1點55分，發現敵人第二批艦隊大約18艘軍艦向南駛過喀拉喀托航道；3點02分，敵人第三批船隊大約32艘艦船向南駛過喀拉喀托航道，其中包括大約15艘運輸船。10分名鍾後重複報告一次，半小時後繼續報告一次！」秦海銘說道，除非在遇到緊急情況時，潛艇部隊的偵察報告一般都會重複報告三次。

    日軍艦隊的動向實際上在離港後就被監視的軸心國潛艇部隊發現。並已經向艦隊作了報告，不過，1026號潛艇的報告則可以確定日軍正在向遭受攻擊的明古魯派出了增援艦隊。

    此時，日軍已經很明確地知道了正在明古魯進行登陸的軸心國船隊和為其提供火力支援的德國艦隊的位置，而且肯定會想到在這支艦隊身後可能還有增援力量，但困擾南雲的問題是他現在無從得知軸心國支援艦隊的規模和具體的位置。

    令外一個讓南雲感到猶豫的原因是他手上的機動艦隊的實力受到了削弱，日本海軍最強的第5航空戰隊的「瑞鶴號」航空母艦在新加坡樟宜海軍基地因受到軸心國轟炸機的轟炸受了點輕傷，但並不妨礙作戰。但海軍軍令部卻下令把第5航空艦隊調回本土進行維修。這極大地削弱了南雲手中的航空力量。

    7月7日凌晨3點20分，南雲中將的旗艦「赤城號」上的擴音器宣布執行空襲任務的飛行員準備出動。航母飛行甲板上的地勤人員已經開始作著飛行著的準備。飛機的發動機開動起來，響起了震耳欲聾的馬達轟鳴聲。

    現在南雲需要作出決斷，是首先攻擊敵人的登陸艦隊還是進攻為登陸船隊護航的艦隊？軸心國的登陸部隊從昨天下午開始從明古魯進行登陸，只有一個大隊擔任守備任務的日本陸軍一直在不停地請求增援。到了晚上，陸軍的通訊已經中斷，再也沒有收到什麼消息。估計這個大隊已經全體「玉碎」。

    現在航空隊就要起飛進行攻擊了，而南雲海軍中將對敵艦隊的動向仍然一無所知。敵人有一支登陸艦隊，另外還有一支護航艦隊，但不清楚對方身後是否還有一支增援艦隊。他對敵情作出了錯誤的判斷：敵人目前還沒有覺察自己的企圖，也沒有發現機動部隊已經出動。

    因此。南雲決定先對軸心國的登陸艦隊進行空襲，支援陸軍的反擊行動，然後再全力對付護航的軸心國艦隊。

    這個決定最終葬送了日本海軍機動部隊所有主力。