以前穆陵軍的主力兵力共分為六個步兵隊，一個弓箭手隊，一個騎兵隊和一個偵察隊，兵力總計為一千六百九十六人。

    現在六個步兵隊，每隊二百人的編制依然都保留。而弓箭手隊擴大為兩個隊，毎隊一百八十人，均為一百二十名長弓手和六十名短弓手。騎兵隊為擴大到一百八十人。偵察隊擴大到一百二十人。各隊的隊長依然由原來的把總擔任。只是騎兵隊的隊長不在由唐鎮兼任，由楊武丞擔任，同時他還兼任士兵的槍術教師。另外增設的火槍隊一共為四百五十人，其中包括五十名炮手。由羅遠斌擔任隊長和教官。

    這樣整編之後，穆陵軍的主力兵力共計是二千三百一十人，基本都是十八至三十五歲的靑年男子。而十四至十八歲的少年有二百八十七人，編為三個小隊。

    從箕厔村遷移到穆陵關的居民一共有三百二十七戶，共計一千0八十七口人，男子六百二十三口，女子四百六十四口。成年男子四百三十八人，其中十八至三十五歲的靑年男子為二百四十一人，三十五至四十五歲的壯年男子為二百0七人。十四至十八歲的少年有九十五人。

    因為箕屋村的團兵經過楊武丞的訓練，基礎還比較好，因此有一倍份成年男子被抽調到騎兵隊裡，商毅將剩下的成年男子編成兩個隊，少年編成一個少年隊。

    這樣一來，穆陵關的總兵力達到了三千多人，實力以經非常可觀了。

    隊伍整編完畢之後，商毅立刻下令，全軍開始進行訓練。

    其實從原來組建民團時開始，到升格成為穆陵軍，士兵們一直都在按照商毅的要求，進行著嚴格的訓練。而這一次訓練的重點，是剛剛加入穆陵軍箕屋村的士兵。首先當然還是從隊列訓練開始。

    和這個時代的大多數武將不同，商毅建軍的第一指導思想是士兵尊守紀律，服從命令的關念習慣，而不是士兵的個人戰鬥能力。在這樣指導思想下，穆陵軍的士兵個人的戰鬥力或許不算強，但作為一個團隊，整體的作戰能力卻不容小視。隊列訓練就是加強士兵尊紀服從觀練的最好方法。

    不過來自箕屋村的新兵顯然對這種枯燥乏味，又極為勞神費力的訓練非常不適應，加上大多數人都是農民出身，在一開始的時候，和當初的士兵一樣，跟本就分不淸左右。

    現在訓練隊例這樣的事情也不用商毅再親力親為，都由穆陵軍過去的老兵付責，這些老兵自然也秉承了商毅的打罵訓練法，一但新兵做錯了動作，就會立刻被老兵們罵了個狗血淋頭，「這麼簡單的事情也不會，都是幹什麼吃的，」「練了幾天也記不住，就是這個樣子，上了戰場也是送死的貨」　一邊罵著，還一邊舉著棍子，打了過來。

    結果幾天下來之後，新兵們幾乎每個人身上都掛上了幾條血印，不過商毅雖然不禁止他們責打士兵，但也不許訓練他們的老兵下重手，更不許打要害部位，基本都是朝肉厚的地方下棍子，因此挨打的新兵雖多，但都沒有傷筋動骨。

    但儘管如此，因為新兵們大多都是剛從農民轉化，以前那裡受過這種折磨，也弄得叫苦不迭。有不少人都大覺吃不消，於是也有人開始耍小聰明，打歪點子，想法偷懶、磨蹭時間等等。

    但商毅對訓練的監督十分嚴格，一但發現有人偷懶、磨蹭，完不成訓練量，也毫不客氣，立刻就拖出去打軍棍。在最初的一段時間，幾乎毎天都有新兵被拖出去挨打。

    不過商毅也知道剛柔湘濟的道理，正所謂是打一巴掌之後，還要給個甜栆吃。大棍也需要胡蘿蔔來配合。因此在責打完士兵之後，就會立刻讓軍醫來給他們上藥，化於消腫，每天還親自看望士兵，弄得城裡的郎中也納悶，要是千總大人真的心疼這些士兵，為啥又要打他們呢？

    而且訓練雖然是苦了一點，但士兵的飯食卻一點也不含糊，老兵就不用說了，既使是新兵，每餐也是一大碗白米飯，外加兩個黑面野菜餅子，隔一天還可以吃到二兩肉，不時還會餎個白面大餅什麼的，給調劑一下。許多新兵就是過去在家裡，也吃不到這樣的飯萊。

    同時商毅也知道，對士兵的思想教育也絕對不能放鬆，因此也安排了一些年紀稍長的老兵，在休息的時候去和新兵談天，做他們的思想工作。

    新兵們覺得訓練累，訓練苦時，老兵就會告訴他們：「這也叫累、也叫苦嗎？