疾控地帶 第7章 新發病例
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忙活了一早上,走出實驗室已經是早晨七點多,剛好是早飯時間。
葉蓁蓁剛到g省疾控,很多地方不熟悉,王亞楠很熱心地帶著葉蓁蓁去了中心食堂,一起吃過早飯,王亞楠嘆道:「我們平時最怕遇到緊急疫情,每次遇到都要加班,這次還好,樣品是早晨五點送到的,以前經常是凌晨一兩點,忙活完,一整晚都不用睡覺了,你們國家cdc也經常這樣吧?」
葉蓁蓁想起之前兒童福利中心爆發的出血熱疫情,當時就是整晚沒睡地做實驗,現在再聽王亞楠的訴苦,感同身受地笑了笑,「嗯,一樣啊。」
想起這次來g省的任務,葉蓁蓁主動要求說:「從百子村死者標本分離出來的炭疽桿菌,你們做了序列分析吧?」
「嗯,昨天剛做了初步序列分析,葉老師,你想看結果?」
「是的,昨晚在報告會上,主講人說過,這次分離出來的炭疽菌株跟b市之前流行的菌株,同源性很低,那跟這次菌株同源性最高的菌株是在哪個流行區分離出來的?」
王亞楠搖搖頭,「昨天跟國內幾個流行株做了初步比對分析,沒有跟這次分離到的菌株同源性超過百分之九十的。」
「什麼?同源性這麼低!按照現在的數據,它都可以單列一個菌種了。」
「是啊,這就是這次疫情奇怪的地方,要不,我們g省疾控也不會向國家cdc求助了,剛才就算葉老師不提這件事,我也要帶你去看昨天做出來的序列分析圖呢。」
「好,現在就去。」
葉蓁蓁匆忙扒完碗裡的飯,催促著王亞楠去實驗室,每次遇到這種奇怪的實驗現象,葉蓁蓁和南之喬的反應一樣,激動又興奮。
王亞楠帶著葉蓁蓁去了實驗樓的計算機房,所有需要進行序列分析,建立進化樹,基因測序的後續工作都在計算機房完成。
g省疾控計算機房規模頗大,六七十平米的房間裡放著八台電腦,西面還放著一排文件櫃,柜子前是一排辦公桌,很空曠的感覺。
計算機房裡已經有兩個人坐在電腦前,王亞楠帶著葉蓁蓁走進機房,眾人點點頭算是打過招呼。
王亞楠在一台電腦坐下,打開電腦,隨手拖過來一張旋轉椅讓葉蓁蓁坐在旁邊。
葉蓁蓁坐在一旁,看著王亞楠從電腦中調出昨天做出的炭疽桿菌序列圖,看了兩眼,葉蓁蓁就發現了問題,一個單獨的序列突出在眾序列之外,序列後面用英文標註著毒株名稱,baizi anthracis ,葉蓁蓁指著電腦屏幕上單突出來的序列,問:「這就是從百子村死者身上分離出來的炭疽桿菌吧?」
「是的,下面這些是從國內各個炭疽流行區選出來的具有代表性的序列,對比分析後,從百子村新分離出來的這株炭疽桿菌因為與其他的同源性太低,所以系統軟體將其單列出來一個分支。」周亞楠一邊盯著電腦屏幕,一邊用納悶的口氣說,「這就是這次炭疽疫情最奇怪的地方。」
葉蓁蓁心想,不會是新出現的變異株吧?每次細菌或病毒發生大的變異時,致病力都會發生相應的改變,這次百子村的祖孫四人發病急,症狀嚴重,可能就是因為新出現的炭疽桿菌發生變異的緣故。
葉蓁蓁說出自己的想法,周亞楠點點頭,解釋說:「這個變異的可能,我之前也想過,所以打算今天對其中的幾個毒力基因做一下分析。」
周亞楠開始調出各種炭疽桿菌的毒力基因,開始對比分析,邊操作軟體邊說:「我們g省疾控用的這些序列分析軟體還是南主任推薦的,分析方法也是之前去中國cdc統一培訓過的,葉老師,這套分析軟體和方法您也很熟悉吧?」
「嗯,這套分析軟體是現在國際通用的,發表sci論文的時候也認可這種方法。」
葉蓁蓁心想著,這套分析方法最初還是南之喬在巴黎的巴斯德研究所教會了自己,後來到了中國cdc南之喬的實驗組,用的就更頻繁了,每次做各種病毒的進化樹,南之喬總是要求將國際上所有分離測序出來的代表毒株都放進進化樹里,說是這樣能全面分析,發現一些意想不到的東西……
想到這裡,葉蓁蓁突然靈機一動,興奮地對身旁的王亞楠說:「百子村分離出來的菌株