朱常淓以帝國基地軍隊為主體，又收服了沒有對南明朝廷沒有二心的黃得功，精心布置之下，以雷霆之勢對江北四鎮之一的劉良佐發動了合圍攻擊。

    劉良佐所部毫無防備，被殺的節節敗退，最終麾下士兵崩潰逃散而去。

    劉良佐本人也被部將給擒殺，砍下了首級向朝廷作為投誠的見面禮。

    其餘潰兵也被黃得功收攏改編，劉良佐徹底滅亡。

    江北四鎮只剩下高傑還沒有歸順朝廷，黃得功受到皇帝授意，以邀請赴宴的名義將高傑騙出軍營，然後趁機綁縛。

    同時派人將高傑手下人馬趁機包圍繳械，並且殺了多爾袞派來聯絡高傑的密使，並將人頭給送了回去。

    高傑無奈之下只能宣誓效忠皇帝，並且把自己的兒子交出來作為人質在南京城中讀書，以表示投降的誠意。

    在順利解決了江北四鎮之後，江北之地終於平靜下來。

    可是此時，在武昌的寧南侯左良玉在其子左夢庚的慫恿之下終於野心膨脹起來，打出了清君側，誅殺馬士英等奸臣的旗號，率領二十多萬大軍沿著長江向南京殺來。

    一時間，朝廷動盪，百官震驚。剛剛才因為平定江北四鎮帶來的平靜又再次被打破，百官驚懼惶恐，人心動亂，謠言四起。

    而此時，從北方又傳來了滿清大軍準備南下的消息，更是讓這動亂的局面雪上加霜，一時之間天下又進入了風雨飄搖的局面。

    在這危難之際，皇帝朱常淓果斷決定御駕親征，親自率領拼湊起來的十萬人馬出了南京城，向九江開去。

    水師總兵方國安也發誓效忠皇帝，帶領水師在九江段江面上與左軍相持，阻攔左軍前進道路，導致左軍進展緩慢。

    皇帝率領的大軍到達九江之後，便擺開陣勢與左軍的二十多萬大軍對峙起來。

    朝廷大軍雖然人數上處於劣勢，但是卻基本上都是精銳，尤其是作為核心戰鬥力的黑犀軍更是強橫無比。

    雙方大戰三場，左軍不但沒有絲毫進展，反而損兵折將，士氣大跌。

    此時，左良玉因為心中鬱結，導致舊疾發作，臥床不起，左軍士氣更是低落。

    此時皇帝見時機成熟，又親自到兩軍陣前施展攻心計，一方面怒斥左氏父子欺君罔上，以下犯上，罪不容恕。另一方面又大度的寬恕所有左軍士兵，認為他們是被矇騙，根本不明真相，所以朝廷不予追究。

    左軍軍心更是大亂，謠言四起。左良玉麾下諸將也是心思各異，一時間暗流涌動，山雨欲來。

    湖廣總督袁繼咸趁夜進入左軍，面見左良玉。與左良玉深談之後，左良玉羞愧不已，悔恨難當，第二日就發病身亡。

    左良玉一死，左軍群龍無首。左夢庚志大才疏，威望不足，大部分士兵都不願意聽他號令，逃跑著無數。

    左良玉無奈之下，帶著少部分人馬準備撤回武昌，然後投降滿清以求出路。

    皇帝抓住機會，命令水師總兵方國安配合黑犀軍主力和黃得功所部，三路夾擊，左夢庚大敗被殺，左軍徹底失敗。

    左氏父子敗亡之後，朝廷大軍趁機攻占了武昌重鎮，部署重病扼制長江中游。

    平定江北四鎮，以及御駕親征擊敗左良玉父子，讓皇帝朱常淓威望大漲，朝野之間稱頌之聲不絕於耳。

    皇帝趁此機會，下令大力擴編新軍，編練軍隊。

    民間壯丁踴躍報名參軍，各地富戶鄉紳也都紛紛捐款捐物，江南各地一片沸騰，朝廷威望逐步建立。

    滿清攝政王多爾袞此時並沒有多餘兵力南下江南，山西，山東兩地的反清運動此起彼伏，讓多爾袞焦頭爛額。

    而且，山西還有大量的大順軍，更是讓滿清朝廷忌憚不已。

    山東各地民眾自發組織起來，由各位鄉紳帶頭組成義軍，自己打造兵器，製造盔甲，旗幟，紛紛占領大順軍撤出後留下的福州縣城。

    滿清排到山東的招撫特使也被義軍驅逐，山東反清運動一時高漲。

    在這種情況下，滿清朝廷之中也出現了不同的聲音，有人要求撤回關外，放棄京城，認為滿清是無法與漢人抗衡的。

    但是多爾袞固執己見，堅持認為滿清有機會問鼎中原，一統江山，因此派遣其弟豫王鐸鐸帶領一支人馬進攻山東。